ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ГАПЛОГРУПП МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК В ДОНСКОЙ ПОРОДЕ ЛОШАДЕЙ
Аннотация
Донская порода лошадей, получившая известность в России уже в середине 18 века, была получена методом длительного скрещивания лошадей кочевников с культурными восточными породами. В связи с сокращением численности поголовья донских маток до 200 племенных кобыл изучение генетических особенностей этой породы приобретает особую актуальность. Целью проведенных исследований было изучение матрилинейной структуры донской породы лошадей на основании филогенетического анализа 530 пар нуклеотидов (п.н.) гипервариабельного участка D-петли митохондриальной ДНК (мтДНК) у 26 кобыл, представляющих основные женские семейства. Анализ последовательности мтДНК проводили с использованием Neighbor-Joining (NJ) метода в сочетании с бутстрэп-анализом в программе MEGA7. В митохондриальных геномах протестированных донских лошадей было выявлено 26 различных гаплотипов, входящих в состав 10 гаплогрупп мтДНК, включая A, B, D, G, L, M, N, O, P и Q, согласно современной классификации. Дополнительно было выявлено еще четыре новых гаплогруппы, ведущих линию от черноморских кобыл и нетипичных для большинства европейских пород. Секвенированный фрагмент D-петли c 15471 по 16000 п.н включал 115 полиморфных сайтов, в основном представленных трансверсиями. В структуре мтДНК донской породы преобладали гаплогруппы G (19.2%), B (15.4%) и L (11.5%). Все проанализированные маточные семейства были четко дифференцированы на уровне гаплогрупп и гаплотипов с высоким показателем бутстрэп-поддержки (58-100%), что свидетельствует о высоком генетическом разнообразии генеалогической матрилинейной структуры донской породы лошадей.
Скачивания
Литература
References
Kashtanov L.V. Donskaya Loshad’ [Don Horse]. Rostov-on-Don: Rostov Book Publishing House, 1939, 152 p.
Kibort M.I., Nikolayeva A.A. Poroda Donskikh Loshadey [Don Horse Breed]. Moscow: Nauchnaya kniga, 2005, 288 p.
Khrabrova L.A., Zaytsev A.M., Kalashnikov V.V., Blokhina N.V., Belousova N.F., Sorokin S.I. Struktura Vyatskoy Porody Loshadey po Gaplogruppam mtDNK [Structure of Vyatskaya Horse Breed by Haplogroups mtDNA]. Konevodstvo i Konny Sport [Horse Breeding and Equestrian Sport], 2020, no. 4, pp. 4–6. https://doi.org/10.25727/HS.2020.4.62190
Khrabrova, L.A. Teoreticheskiye i Prakticheskiye Aspekty Geneticheskogo Monitoringa v Konevodstve [Characterization of Genetic Horse Breeding Resources in Russia]: Abstract of the thesis. doctor of agricultural sciences. Divovo, 2011,38 p.
Achilli A., Soares P., Olivieri. A., Lancioni H. Mitochondrial genomes from modern horses reveal the major haplogroups that underwent domestication. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2012, vol. 109, no. 7, pp. 2449-2454. http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1111637109
Bigi D., Perrota G., Zambonelli P. Genetic analysis of seven Italian horse breeds on mitochondrial DNA D-loop variation. Animal Genetics, 2014, vol. 45, no. 4, pp. 593-595. http://dx.doi.org/10.1111/age.12156
Bowling A.T., Del Valle A., Bowling M. A pedigree-based study of mitochondrial D-loop DNA sequence variation among Arabian. Animal Genetics, 2000, vol. 31, no. 1, pp. 1-7. https://doi.org/10.1046/J.1365-2052.2000.00558.X
Cardinali I., Lancioni H., Giontella A., Capodiferro M.R., Capomaccio S., Buttazzoni L., Biggio P.G., Cherchi R., Albertini E., Olivieri A., Cappelli K., Achilli A., Silvestrelli M. An overview of ten Italian horse breeds through mitochondrial DNA. PloS ONE, 2016, vol. 11, no. 4, e0153004. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0153004
Cieslak M., Pruvost M., Benecke N., Hofreiter M., Morales A., Reissmann M., Ludwig A. Origin and history of mitochondrial DNA lineages in domestic horses. PloS ONE, 2010, vol. 5, no. 12, e15311. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0015311
Dell A.C., Curry M.C., Yarnell K.M, Starbuck G.R., Wilson P.B. Mitochondrial D-loop sequence variation and maternal lineage in the endangered Cleveland Bay horse. PLoS ONE, 2020, vol. 15, no. 12, e0243247. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0243247
Hill E.W., Bradley M., Al-Barody M.E., Ertugrul O. (2002) History and integrity of Thoroughbred dam lines revealed in equine mtDNA variation. Animal Genetics, vol. 33, no. 4, pp. 287-294. http://dx.doi.org/10.1046/j.1365-2052.2002.00870.x
Jansen T., Foster P., Levine M.A., Oelke H. Mitochondrial DNA and the origin of the domestic horse. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2002, vol. 99, no. 16, 10905-10910. http://dx.doi.org/10.1073/pnas.152330099
Khanshour A.M., Cothran E.G. Maternal phylogenetic relationships and genetic variation among Arabian horse populations using whole mitochondrial DNA D-loop sequencing. BMC Genetics, 2013, vol. 14, no. 1, p. 83. http://dx.doi.org/10.1186/1471-2156-14-83
Khaudov A.D., Duduev A.S., Kokov Z.A., Amshokov K.K. Genetic analysis of maternal and paternal lineages in Kabardian horses by uniparental molecular markers. Open Veterinary Journal, 2018, vol. 8, no. 1, pp. 40-46. http://dx.doi.org/10.4314/ovj.v8i1.7
Lopes M.S., Mendonca D., Cymbron. T., Valera M. The Lusitano horse maternal lineage based on mitochondrial D-loop sequence variation. Animal Genetics, 2006, vol. 36, no. 3, pp. 196-202. http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2052.2005.01279.x
McGahern A., Bower M.A., Edwards C.J.P., Brophy O. Evidence for biogeographic patterning of mitochondrial DNA in Eastern horse populations. Animal Genetics, 2006, vol. 37, no. 5, pp. 494-497. http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2052.2006.01495.x
Scherf B.D., Pilling D. The Second Report on the State of the World’s Animal Genetic Resources for Food and Agriculture. Rome: FAO, 562 p.
Xu X., Arnason U. The complete mitochondrial DNA sequence of the horse. Equus caballus: Extensive heteroplasmy of control region. Gene, 1994, no. 1480, pp. 357-362. https://doi.org/10.1016/0378-1119%2894%2990713-7
Список литературы
Каштанов Л.В. Донская лошадь. Р.: Ростовское книжное издательство, 1939. 152 с.
Киборт М.И., Николаева А.А. Порода Донских лошадей. М.: Научная книга, 2005. 288 с.
Структура вятской породы лошадей по гаплогруппам МТДНК / Храброва Л.А., Зайцев А.М., Калашников В.В., Блохина Н.В., Белоусова Н.Ф., Сорокин С.И. // Коневодство и конный спорт. 2020. № 4. С. 4-6. https://doi.org/10.25727/HS.2020.4.62190
Храброва, Л.А. Теоретические и практические аспекты генетического мониторинга в коневодстве: Aвтореферат дис. доктора сельскохозяйственных наук. Д., 2011. 38 с.
Achilli A., Soares P., Olivieri. A., Lancioni H. Mitochondrial genomes from modern horses reveal the major haplogroups that underwent domestication // Proceedings of the national academy of sciences, 2012, vol. 109, no. 7, pp. 2449-2454. http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1111637109
Bigi D., Perrota G., Zambonelli P. Genetic analysis of seven Italian horse breeds on mitochondrial DNA D-loop variation // Animal genetics, 2014, vol. 45, no. 4, pp. 593-595. http://dx.doi.org/10.1111/age.12156
Bowling A.T., Del Valle A., Bowling M. A pedigree-based study of mitochondrial D-loop DNA sequence variation among Arabian // Animal genetics, 2000, vol. 31, no. 1, pp. 1-7. https://doi.org/10.1046/J.1365-2052.2000.00558.X
Cardinali I., Lancioni H., Giontella A., Capodiferro M.R., Capomaccio S., Buttazzoni L., Biggio P.G., Cherchi R., Albertini E., Olivieri A., Cappelli K., Achilli A., Silvestrelli M. An overview of ten Italian horse breeds through mitochondrial DNA // PloS One, 2016, vol. 11, no. 4, e0153004. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0153004
Cieslak M., Pruvost M., Benecke N., Hofreiter M., Morales A., Reissmann M., Ludwig A. Origin and history of mitochondrial DNA lineages in domestic horses // PloS One, 2010, vol. 5, no. 12, e15311. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0015311
Dell A.C., Curry M.C., Yarnell K.M, Starbuck G.R., Wilson P.B. Mitochondrial D-loop sequence variation and maternal lineage in the endangered Cleveland Bay horse // PLoS ONE, 2020, vol. 15, no. 12, e0243247. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0243247
Hill E.W., Bradley M., Al-Barody M.E., Ertugrul O. (2002) History and integrity of Thoroughbred dam lines revealed in equine mtDNA variation // Animal genetics, vol. 33, no. 4, pp. 287-294. http://dx.doi.org/10.1046/j.1365-2052.2002.00870.x
Jansen T., Foster P., Levine M.A., Oelke H. Mitochondrial DNA and the origin of the domestic horse // Proceedings of the national academy of sciences, 2002, vol. 99, no. 16, 10905-10910. http://dx.doi.org/10.1073/pnas.152330099
Khanshour A.M., Cothran E.G. Maternal phylogenetic relationships and genetic variation among Arabian horse populations using whole mitochondrial DNA D-loop sequencing // BMC genetics, 2013, vol. 14, no. 1, p. 83. http://dx.doi.org/10.1186/1471-2156-14-83
Khaudov A.D., Duduev A.S., Kokov Z.A., Amshokov K.K. Genetic analysis of maternal and paternal lineages in Kabardian horses by uniparental molecular markers // Open veterinary journal, 2018, vol. 8, no. 1, pp. 40-46. http://dx.doi.org/10.4314/ovj.v8i1.7
Lopes M.S., Mendonca D., Cymbron. T., Valera M. The Lusitano horse maternal lineage based on mitochondrial D-loop sequence variation // Animal genetics, 2006, vol. 36, no. 3, pp. 196-202. http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2052.2005.01279.x
McGahern A., Bower M.A., Edwards C.J.P., Brophy O. Evidence for biogeographic patterning of mitochondrial DNA in Eastern horse populations // Animal genetics, 2006, vol. 37, no. 5, pp. 494-497. http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2052.2006.01495.x
Scherf B.D., Pilling D. The second report on the state of the world’s animal genetic resources for food and agriculture. Rome: FAO, 562 p.
Xu X., Arnason U. The complete mitochondrial DNA sequence of the horse. Equus caballus: Extensive heteroplasmy of control region // Gene, 1994, no. 1480, pp. 357-362. https://doi.org/10.1016/0378-1119%2894%2990713-7
Просмотров аннотации: 111 Загрузок PDF: 77
Copyright (c) 2023 Liudmila A. Khrabrova, Anna A. Nikolaeva, Nina V. Blohina, Sergey I. Sorokin
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial-NoDerivatives» («Атрибуция — Некоммерческое использование — Без производных произведений») 4.0 Всемирная.
