Состав и прогнозируемые функции эндометриального и рубцового микробиома дойных коров на фоне хронического эндометритa

  • Elena A. Yildirim Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский государственный аграрный университет»; ООО «БИОТРОФ+» https://orcid.org/0000-0002-5846-5105
  • Valentina A. Filippova Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский государственный аграрный университет»; ООО «БИОТРОФ+» https://orcid.org/0000-0001-8789-9837
  • Larisa A. Ilina Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский государственный аграрный университет»; ООО «БИОТРОФ+» https://orcid.org/0000-0003-2789-4844
  • Georgy Yu. Laptev Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский государственный аграрный университет»; ООО «БИОТРОФ+» https://orcid.org/0000-0002-8795-6659
  • Andrey V. Dubrovin ООО «БИОТРОФ+» https://orcid.org/0000-0001-8424-4114
  • Vasily A. Zaikin ООО «БИОТРОФ+» https://orcid.org/0009-0006-8029-9955
  • Ksenia A. Kalitkina Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский государственный аграрный университет»; ООО «БИОТРОФ+» https://orcid.org/0000-0002-9541-6839
  • Elena A. Korochkina Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт‑Петербургский государственный университет ветеринарной медицины» https://orcid.org/0000-0002-7011-4594
  • Irina A. Klyuchnikova Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский государственный аграрный университет»; ООО «БИОТРОФ+» https://orcid.org/0009-0008-6484-1235
  • Ekaterina S. Ponomareva ООО «БИОТРОФ+» https://orcid.org/0000-0002-4336-8273
  • Evgeny A. Brazhnik ООО «БИОТРОФ+» https://orcid.org/0000-0003-2178-9330
  • Tatyana S. Smetannikova Акционерное общество «Гатчинское»
  • Daria G. Tyurina ООО «БИОТРОФ+» https://orcid.org/0000-0001-9001-2432
Ключевые слова: эндометрит, эндометрий, рубец, микробиом, дойные коровы

Аннотация

Обоснование. Эндометрит является одной из важнейших причин яловости молочных коров, приводящей к значительным экономическим потерям в животноводстве. Состав микробиома коров оказывает прямое влияние на их репродуктивное здоровье.

Целью исследования была оценка изменений состава и прогнозируемых метаболических путей эндометриальной и рубцовой микробиоты коров при хроническом эндометрите.

Материалы и методы. Для эксперимента было сформировано две группы коров в период раздоя (n = 3): контрольная группа I - клинически здоровые, а также с хорошими показателями воспроизводства в анамнезе жизни, опытная группа II - с хроническим эндометритом. Была проведена оценка состава микробного сообщества соскобов с эндометрия и химуса рубца с помощью таргетного NGS-секвенирования. Реконструкция и прогнозирование функционального содержания семейств генов и ферментов проведены при помощи программного комплекса PICRUSt2 (v.2.3.0).

Результаты. В рубце коров опытной группы II по сравнению с контролем I было отмечено снижение численности Ruminococcus sp. и Veillonella sp. в 2,0 и 2,8 раза соответственно на фоне повышения Fusobacterium sp. и бактерий порядка Bacteroidales – родов Bacteroides и Porphyromonas в 1,7-2,6 раза (Р≤0,05). В эндометрии коров опытной группы II по сравнению с контролем I отмечено резкое (на 8,6%) увеличение численности Fusobacterium sp. (Р≤0,05). У эндометриальной микробиоты на фоне заболевания происходило полное угнетение важных путей, связанных с синтезом витаминов, таких, как менахинол-10 и биотин, а также коэнзима Q10 (убихинолов-7-10), связанного с антиоксидантной активностью по сравнению контрольной группой I (Р≤0,05).

Заключение. Полученные нами данные указывают на то, что хронический эндометрит у коров проявляется как смешанная инфекция, этиологическим началом которой, по всей вероятности, является увеличение численности микроорганизмов, присутствующих в репродуктивной системе клинически здоровых коров.  Результаты нашего исследования предоставляют дополнительную информацию о механизмах развития хронического эндометрита у коров.

EDN: QWWMIL

Скачивания

Данные скачивания пока не доступны.

Биографии авторов

Elena A. Yildirim, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский государственный аграрный университет»; ООО «БИОТРОФ+»

доктор биологических наук, профессор кафедры крупного животноводства

Valentina A. Filippova, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский государственный аграрный университет»; ООО «БИОТРОФ+»

заведующий лабораторией кафедры крупного животноводства

Larisa A. Ilina, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский государственный аграрный университет»; ООО «БИОТРОФ+»

доктор биологических наук, профессор кафедры крупного животноводства

Georgy Yu. Laptev, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский государственный аграрный университет»; ООО «БИОТРОФ+»

доктор биологических наук; директор

Andrey V. Dubrovin, ООО «БИОТРОФ+»

кандидат ветеринарных наук, биотехнолог молекулярно-генетической лаборатории

Vasily A. Zaikin, ООО «БИОТРОФ+»

биотехнолог молекулярно-генетической лаборатории

Ksenia A. Kalitkina, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский государственный аграрный университет»; ООО «БИОТРОФ+»

аспирант факультета зооинженерии и биотехнологий

Elena A. Korochkina, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт‑Петербургский государственный университет ветеринарной медицины»

доцент кафедры акушерства и оперативной хирургии

Irina A. Klyuchnikova, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Санкт-Петербургский государственный аграрный университет»; ООО «БИОТРОФ+»

магистрант факультета зооинженерии и биотехнологий

Ekaterina S. Ponomareva, ООО «БИОТРОФ+»

биотехнолог молекулярно-генетической лаборатории

Evgeny A. Brazhnik, ООО «БИОТРОФ+»

контролер по качеству

Tatyana S. Smetannikova, Акционерное общество «Гатчинское»

главный зоотехник по племенной работе

Daria G. Tyurina, ООО «БИОТРОФ+»

главный биотехнолог молекулярно-генетической лаборатории

Литература

Белик, С. В., Аль-Рикаби, З. Г. К., & Лободин, К. А. (2014). Эффективность применения НПВС для профилактики эмбриональной смертности у молочных коров. Вопросы нормативно-правового регулирования в ветеринарии, (3), 25-26.

Belik, S. V., Al-Rikabi, Z. G. K., & Lobodin, K. A. (2014). Effektivnost primeneniya NPVS dlya profilaktiki embrional'noy smertnosti u molochnykh korov [The effectiveness of NSAIDs for preventing embryonic death in dairy cows]. Voprosy normativno-pravovogo regulirovaniya v veterinariy, (3), 25-26.

Вахитов, И. И., Багманов, М. А., Шаев, Р. К., & Хасанов, А. Р. (2012). Изучение этиологии и распространения послеродовых эндометритов у коров в хозяйствах Республики Татарстан. Ученые записки КГАВМ им. Н. Э. Баумана, (3), 229-233.

Vakhitov, I. I., Bagmanov, M. A., Shaev, R. K., & Khassanov, A. R. (2012). Izucheniye etiologii i rasprostraneniya poslerodovykh endometritov u korov v khozyaistvakh Respubliki Tatarstan [Study of the etiology and spread of postpartum endometritis in cows in farms of the Republic of Tatarstan]. Uchenyye zapiski Kazanskoy gosudarstvennoy akademii veterinarnoy meditsiny imeni N.E. Bауmana, (3), 229-233.

Карташов, С. Н., Клименко, Р. В., Карташова, Е. В., & Грибов, К. П. (2010). Гормональные нарушения в этиологии хронических эндометритов у коров. Ветеринария и кормление, (4), 22-30.

Kartashov, S. N., Klimenko, R. V., Kartashova, E. V., & Gribov, K. P. (2010). Gormonal'nyye narusheniya v etiologii khronicheskikh endometritov u korov [Hormonal disorders in the etiology of chronic endometritis in cows]. Veterinariya i kormleniye, (4), 22-30.

Коба, И. С., Решетка, М. Б., & Дубовикова, М. С. (2016). Распространение острых и хронических эндометритов у коров в сельскохозяйственных организациях Краснодарского края. Вестник АГАУ, (2), 103-106.

Koba, I. S., Reshetka, M. B., & Dubovikova, M. S. (2016). Rasprostraneniye ostrykh i khronicheskikh endometritov u korov v sel'skokhozyaistvennykh organizatsiyakh Krasnodarskogo kraya [Prevalence of acute and chronic endometritis in cows at agricultural organizations in the Krasnodar region]. Vestnik Altayskogo gosudarstvennogo agrarnogo universiteta, (2), 103-106.

Adnane, M., & Chapwanya, A. (2022). Role of genital tract bacteria in promoting endometrial health in cattle. Microorganisms, 10(11), 2238. https://doi.org/10.3390/microorganisms10112238

Appiah, M. O., Wang, J., & Lu, W. (2020). Microflora in the reproductive tract of cattle: A review. Agriculture, 10(6), 232. https://doi.org/10.3390/agriculture10060232

Baker, J. M., Al-Nakkash, L., & Herbst-Kralovetz, M. M. (2017). Estrogen–gut microbiome axis: Physiological and clinical implications. Maturitas, 103, 45–53. https://doi.org/10.1016/j.maturitas.2017.06.025

Benner, M., Ferwerda, G., Joosten, I., & van der Molen, R. G. (2018). How uterine microbiota might be responsible for a receptive, fertile endometrium. Human Reproduction Update, 24, 393–415. https://doi.org/10.1093/humupd/dmy012

Bodelon, C., Madeleine, M. M., Johnson, L. G., Du, Q., Galloway, D. A., Malkki, M., et al. (2014). Genetic variation in the TLR and NF-kappaB pathways and cervical and vulvar cancer risk: A population-based case-control study. International Journal of Cancer, 134(2), 437–444. https://doi.org/10.1002/ijc.28364

Carneiro, L. C., Cronin, J. G., & Sheldon, I. M. (2016). Mechanisms linking bacterial infections of the bovine endometrium to disease and infertility. Reproductive Biology, 16, 1–7. https://doi.org/10.1016/j.repbio.2016.04.003

Cirilli, I., Damiani, E., Dludla, P. V., Hargreaves, I., Marcheggiani, F., Millichap, L. E., Orlando, P., Silvestri, S., & Tiano, L. (2021). Role of coenzyme Q10 in health and disease: An update on the last 10 years (2010–2020). Antioxidants, 10(8), 1325. https://doi.org/10.3390/antiox10081325

Eckel, E. F., & Ametaj, B. N. (2016). Invited review: Role of bacterial endotoxins in the etiopathogenesis of periparturient diseases of transition dairy cows. Journal of Dairy Science, 99, 5967–5990. https://doi.org/10.3168/jds.2015-10727

Elad, D., Friedgut, O., Alpert, N., Stram, Y., Lahav, D., Tiomkin, D., Avramson, M., Grinberg, K., & Bernstein, M. (2004). Bovine necrotic vulvovaginitis associated with Porphyromonas levii. Emerging Infectious Diseases, 10(3), 505–507. https://doi.org/10.3201/eid1003.020592

Fu, Y., He, Y., Xiang, K., Zhao, C., He, Z., Qiu, M., Hu, X., & Zhang, N. (2022). The role of rumen microbiota and its metabolites in subacute ruminal acidosis (SARA)-induced inflammatory diseases of ruminants. Microorganisms, 10, 1495. https://doi.org/10.3390/microorganisms10081495

Galvão, K. N., Bicalho, R. C., & Jeon, S. J. (2019). Symposium review: The uterine microbiome associated with the development of uterine disease in dairy cows. Journal of Dairy Science, 102, 11786–11797. https://doi.org/10.3168/jds.2019-16654

Gholiof, M., Adamson-De Luca, E., & Wessels, J. M. (2022). The female reproductive tract microbiotas, inflammation, and gynecological conditions. Frontiers in Reproductive Health, 4, 963752. https://doi.org/10.3389/frph.2022.963752

Herath, S., Lilly, S. T., Fischer, D. P., Williams, E. J., Dobson, H., Bryant, C. E., & Sheldon, I. M. (2009). Bacterial lipopolysaccharide induces an endocrine switch from prostaglandin F2α to prostaglandin E2 in bovine endometrium. Endocrinology, 150, 1912–1920. https://doi.org/10.1210/en.2008-1510

Khafipour, E., Krause, D., & Plaizier, J. (2009). A grain-based subacute ruminal acidosis challenge causes translocation of lipopolysaccharide and triggers inflammation. Journal of Dairy Science, 92, 1060–1070. https://doi.org/10.3168/jds.2008-1389

Khan, K. N., Fujishita, A., Kitajima, M., Hiraki, K., Nakashima, M., & Masuzaki, H. (2014). Intra-uterine microbial colonization and occurrence of endometritis in women with endometriosis. Human Reproduction, 29(11), 2446–2456. https://doi.org/10.1093/humrep/deu222

Koedooder, R., Singer, M., Schoenmakers, S., Savelkoul, P. H. M., Morré, S. A., de Jonge, J. D., et al. (2019). The vaginal microbiome as a predictor for outcome of in vitro fertilization with or without intracytoplasmic sperm injection: A prospective study. Human Reproduction, 34, 1042–1054. https://doi.org/10.1093/humrep/dez065

Łaniewski, P., Ilhan, Z. E., & Herbst-Kralovetz, M. M. (2020). The microbiome and gynaecological cancer development, prevention and therapy. Nature Reviews Urology, 17(4), 232–250. https://doi.org/10.1038/s41585-020-0286-z

Miranda-CasoLuengo, R., Lu, J., Williams, E. J., Miranda-CasoLuengo, A. A., Carrington, S. D., Evans, A. C. O., & Meijer, W. G. (2019). Delayed differentiation of vaginal and uterine microbiomes in dairy cows developing postpartum endometritis. PLoS ONE, 14, e0200974. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0200974

Mirmonsef, P., Gilbert, D., Zariffard, M. R., Hamaker, B. R., Kaur, A., Landay, A. L., et al. (2011). The effects of commensal bacteria on innate immune responses in the female genital tract. American Journal of Reproductive Immunology, 65(3), 190–195. https://doi.org/10.1111/j.1600-0897.2010.00943.x

Mogheiseh, A., Ahmadi, M. R., Nazifi, S., Mirzaei, A., & Fallah, E. (2020). Destination of corpus luteum in postpartum clinical endometritis cows and factors affecting self-recovery. Veterinary Animal Science, 9, 100067. https://doi.org/10.1016/j.vasci.2020.100067

Moorey, S. E., & Biase, F. H. (2020). Beef heifer fertility: Importance of management practices and technological advancements. Journal of Animal Science and Biotechnology, 11, 97. https://doi.org/10.1186/s40104-020-00503-9

Plaizier, J. C., Li, S., Tun, H. M., & Khafipour, E. (2016). Nutritional models of experimentally-induced subacute ruminal acidosis (SARA) differ in their impact on rumen and hindgut bacterial communities in dairy cows. Frontiers in Microbiology, 7, 2128. https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.02128

Prunner, I., Wagener, K., Pothmann, H., Ehling-Schulz, M., & Drillich, M. (2014). Risk factors for uterine diseases on small- and medium-sized dairy farms determined by clinical, bacteriological, and cytological examinations. Theriogenology, 82, 857–865. https://doi.org/10.1016/j.theriogenology.2014.06.015

Schoenhofen, I. C., Vinogradov, E., Whitfield, D. M., Brisson, J. R., & Logan, S. M. (2009). The CMP-legionaminic acid pathway in Campylobacter: Biosynthesis involving novel GDP-linked precursors. Glycobiology, 19(7), 715–725. https://doi.org/10.1093/glycob/cwp039

Sheldon, I. M., Lewis, G. S., LeBlanc, S., & Gilbert, R. O. (2006). Defining postpartum uterine disease in cattle. Theriogenology, 65, 1516–1530. https://doi.org/10.1016/j.theriogenology.2005.08.021

Sommer, F., & Bäckhed, F. (2013). The gut microbiota—masters of host development and physiology. Nature Reviews Microbiology, 11(4), 227–238. https://doi.org/10.1038/nrmicro297

Swartz, J. D., Lachman, M., Westveer, K., O’Neill, T., Geary, T., Kott, R. W., Berardinelli, J. G., Hatfield, P. G., Thomson, J. M., Roberts, A., & Yeoman, C. J. (2014). Characterization of the vaginal microbiota of ewes and cows reveals a unique microbiota with low levels of lactobacilli and near-neutral pH. Frontiers in Veterinary Science, 1, 19. https://doi.org/10.3389/fvets.2014.00019

Thomson, P., Pareja, J., Nuñez, A., Santibáñez, R., & Castro, R. (2022). Characterization of microbial communities and predicted metabolic pathways in the uterus of healthy mares. Open Veterinary Journal, 12(6), 797–805. https://doi.org/10.5455/OVJ.2022.v12.i6.3

Williams, E. J., Fischer, D. P., Pfeiffer, D. U., England, G. C. W., Noakes, D. E., Dobson, H., et al. (2005). Clinical evaluation of postpartum vaginal mucus reflects uterine bacterial infection and the immune response in cattle. Theriogenology, 63, 102–117. https://doi.org/10.1016/j.theriogenology.2004.03.017

Zangl, I., Pap, I. J., Aspöck, C., & Schüller, C. (2019). The role of Lactobacillus species in the control of Candida via biotrophic interactions. Microbial Cell, 7(1), 1–14. https://doi.org/10.15698/mic2020.01.702

Zeng, J., Lv, J., Duan, H., Yang, S., Wu, J., Yan, Z., Zhang, R., Hu, J., & Zhang, Y. (2023). Subacute ruminal acidosis as a potential factor that induces endometrium injury in sheep. International Journal of Molecular Sciences, 24(2), 1192. https://doi.org/10.3390/ijms24021192

Опубликован
2025-02-28
Как цитировать
Yildirim, E., Filippova, V., Ilina, L., Laptev, G., Dubrovin, A., Zaikin, V., Kalitkina, K., Korochkina, E., Klyuchnikova, I., Ponomareva, E., Brazhnik, E., Smetannikova, T., & Tyurina, D. (2025). Состав и прогнозируемые функции эндометриального и рубцового микробиома дойных коров на фоне хронического эндометритa. Siberian Journal of Life Sciences and Agriculture, 17(1). https://doi.org/10.12731/2658-6649-2025-17-1-1042
Раздел
Физиология человека и животных