ВАРИАНТ RS475678587C>T ГЕНА UBE3B (ГАПЛОТИП AH1) У АЙРШИРСКОГО СКОТА, ПОВЫШАЮЩИЙ РИСК МЕРТВОРОЖДЕНИЯ У ДОЧЕРЕЙ БЫКОВ-НОСИТЕЛЕЙ
Аннотация
Целью нашего исследования был анализ динамики воспроизводства поголовья айрширского скота в России, а также оценка уровня влияния гаплотипа АН1 на частоту мертворождений. Для общей оценки рождаемости мы использовали 390769 записей 67 молочных стад в России с 2003 по 2018 г. На фоне стабильного прироста поголовья средняя мертворождаемость составила 3,33%, абортов – 0,075%. Выявлен высокий процент мертворождений (5,13%) у телок при первом оплодотворении, а также высокий уровень абортов у коров старшего возраста (11 отелов, 1,76%). Анализ 62534 записей у быков с вариантом rs475678587C>T гена UBE3B (гаплотип АН1) (n = 69, из них 51 бык был свободен от АН1 и 18 были носителями) за период с 2002 по 2018 г. показал, что доля потомства самок быков AH1-C, завершивших хотя бы один полный период лактации, составляло около одной трети всего поголовья. Анализ результатов спаривания самок с быками AH-F и AH-C по маточному стаду в целом (без учета генотипа самок) не выявил существенных различий по количеству мертворождений и абортов. Линейный регрессионный анализ показал, что статус быков АН1 существенно не влиял на уровень мертворождаемости. Анализ результатов отелов и воспроизводительной способности потомства быков АН-С показал увеличение частоты мертворождений, подтвержденное результатами линейного регрессионного анализа, выявившего достоверное влияние отцов-быков-носителей АН1 на долю мертворождений, у их дочерей. Наши исследования подтверждают, что вариант rs475678587C>T гена UBE3B (гаплотип AH1) оказывает существенное влияние на частоту мертворождения у коровы или телки, если их отец является носителем этого генетического дефекта.
Скачивания
Литература
References / Список литературы
Baumgartner W. Fetal disease and abortion: diagnosis and causes. In: Richard M. Hopper D.V.M., Diplomat A.C.T. Bovine reproduction, 2021, pp. 665-716. https://doi.org/10.1002/9781119602484.ch56
Bengtsson C., Stalhammar H., Thomasen J.R., Eriksson S., Fikse W.F., Strandberg E. Mating allocations in Nordic Red Dairy Cattle using genomic information. J. Dairy Sci., 2021, vol. 105(2), pp. 1281-1297. https://doi.org/10.3168/jds.2021-20849
Berglund B. Genetic improvement of dairy cow reproductive performance // Reprod. Dom. An., 2008, vol. 43, pp. 89–95. https://doi.org/10.1111/j.1439-0531.2008.01147.x
Haplotypes Affecting Fertility in the Ayrshire Breed. https://www.cdn.ca/document.php?id=482
Update on Haplotypes Including JNS for Jerseys. https://www.cdn.ca/document.php?id=557
Chen X., Qi Y., Wang X., Wang Z., Wang L., Song A., Xu Y. RPAP2 regulates a transcription initiation checkpoint by prohibiting assembly of preinitiation complex. bioRxiv, 2021. https://doi.org/10.1101/2021.06.18.448918
Cole J.B., Wiggans G.R. VanRaden P.M. Genetic evaluation of stillbirth in United States Holsteins using a sire-maternal grandsire threshold model. J. Dairy Sci., 2007, vol. 90(5), pp. 2480-2488. https://doi.org/10.3168/jds.2006-435
Cole J.B. A simple strategy for managing many recessive disorders in a dairy cattle breeding program. Genet. Sel. Evol., 2015, vol. 47, pp. 94. https://doi.org/10.1186/s12711-015-0174-9
Cooper T.A., Wiggans, G.R., Null D.J., Hutchison J.L., Cole J.B. Genomic evaluation, breed identification, and discovery of a haplotype affecting fertility for Ayrshire dairy cattle. J. Dairy Sci., 2014, vol. 97(6), pp. 3878-3882. https://doi.org/10.3168/jds.2013-7427
Donald H.P. Perinatal deaths among calves in a crossbred dairy herd. Anim. Sci., 1963, vol. 5(1), pp. 87-95.
Fritz S., Capitan A., Djari A., Rodriguez S. C., Barbat A., Baur A., Boichard D. Detection of haplotypes associated with prenatal death in dairy cattle and identification of deleterious mutations in GART, SHBG and SLC37A2. PloS one, 2013, vol. 8(6), pp. e65550. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0065550
Gebreyesus G., Sahana G., Sorensen A.C., Lund M.S., Su G. Novel approach to incorporate information about recessive lethal genes increases the accuracy of genomic prediction for mortality traits. Hered, 2020, vol. 125(3), pp. 155-166. https://doi.org/10.1038/s41437-020-0329-5
Georges M., Charlier C., Hayes, B. Harnessing genomic information for livestock improvement. Nat. Rev. Gen., 2019, vol. 20(3), pp. 135-156. https://doi.org/10.1038/s41576-018-0082-2
Guarini A.R., Sargolzaei M., Brito L.F., Kroezen V., Lourenco D.A.L., Baes C.F., Miglior F., Cole J.B., Schenkel F.S. Estimating the effect of the deleterious recessive haplotypes AH1 and AH2 on reproduction performance of Ayrshire cattle. J Dairy Sci., 2019, vol. 102(6), pp. 5315-5322. https://doi.org/10.3168/jds.2018-15366
Heringstad B., Chang Y.M., Svendsen M., Gianola D. Genetic analysis of calving difficulty and stillbirth in Norwegian Red cows. J. Dairy Sci., 2007, vol. 90(7), pp. 3500-3507. https://doi.org/10.3168/jds.2006-792
Hietala P., Wolfova M., Wolf J., Kantanen J., Juga J. Economic values of production and functional traits, including residual feed intake, in Finnish milk production. J. Dairy Sci., 2014, vol. 97(2), pp. 1092-1106. https://doi.org/10.3168/jds.2013-7085
Juozaitiene V., Juozaitis A., Kardisauskas A., Zymantiene J., Zilaitis V., Antanaitis R., Ruzauskas M. Relationship between dystocia and the lactation number, stillbirth and mastitis prevalence in dairy cows. Acta Vet. Brno., 2018, vol. 86(4), pp.345-352. https://doi.org/10.2754/avb201786040345
Kadri N.K., Sahana G., Charlier C., Iso-Touru T., Guldbrandtsen B., Karim L., Druet T. A 660-Kb deletion with antagonistic effects on fertility and milk production segregates at high frequency in Nordic Red cattle: additional evidence for the common occurrence of balancing selection in livestock. PLoS Genet., 2014, vol. 10(1), e1004049. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1004049
Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. MEGA X: molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms. Molecular biology and evolution, 2018, vol. 35(6), 1547. https://doi.org/10.1093/molbev/msy096 2018
Mee J.F. Why do so many calves die on modern dairy farms and what can we do about calf welfare in the future? Animals, 2013, vol. 3(4), pp. 1036-1057. https://doi.org/10.3390/ani3041036
Null D.J., Hutchinson J.L., Bickhart D.M., VanRaden P.M., Cole J.B. Discovery of a haplotype affecting fertility in Ayrshire dairy cattle and identification of a putative causal variant. J. Dairy Sci., 2017, vol. 100(Suppl. 2), pp. 199(abstr. 206).
Pozovnikova M., Tulinova O., Krutikova A., Mitrofanova O., Dementieva N. Monitoring and significance of the recessive genetic defect AH1 of Ayrshire cattle. Czech J. Anim. Sci., 2020, vol. 65, pp. 323–329. https://doi.org/10.17221/110/2020-CJAS
Seppa-Lassila L., Sarjokari K., Hovinen M., Soveri T., Norring M. Management factors associated with mortality of dairy calves in Finland: A cross sectional study. Vet. J., 2016, vol. 216, pp. 164-167. https://doi.org/10.1016/j.tvjl.2016.07.008
Сергеев С.М., Тулинова О.В. Селекционно-генетическая статистика – ВНИИГРЖ. Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ РФ, №. 2015663613, 2015.
Storlien H. Effekt av AH1 pa dodfodsler og tidlig utranger-ing av kalv hos NRF. Master’s thesis, Norwegian University of Life Sciences, Norway, 2018, 54 p.
Taylor J.F., Schnabel R.D., Sutovsky P. Genomics of bull fertility. Animal, 2018, vol. 12(s1), pp. s172-s183. https://doi.org/10.1017/S1751731118000599
Upperman L.R., Kinghorn B.P., MacNeil M.D., Van Eenennaam A.L. Management of lethal recessive alleles in beef cattle through the use of mate selection software. Genet. Sel. Evol., 2019, vol. 51(1), pp. 1-16. https://doi.org/10.1186/s12711-019-0477-3
Venhoranta H., Pausch H., Flisikowski K., Wurmser C., Taponen J., Rautala H., Kind A., Schnieke A., Fries R., Lohi H., Andersson M. In frame exon skipping in UBE3B is associated with developmental disorders and increased mortality in cattle. BMC Genomics, 2014, vol. 15(1), pp. 890–98. https://doi.org/10.1186/1471-2164-15-890
Winder C.B., Bauman C.A., Duffield T.F., Barkema H.W., Keefe G.P., Dubuc J., Kelton D.F. Canadian national dairy study: Heifer calf management. J. Dairy Sci., 2018, vol. 101(11), pp. 10565-10579. https://doi.org/10.3168/jds.2018-14680
Просмотров аннотации: 192 Загрузок PDF: 142
Copyright (c) 2023 Olga V. Tulinova, Ekaterina N. Vasilyeva, Elena A. Romanova, Yuriy S. Shcherbakov, Marina V. Pozovnikova
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial-NoDerivatives» («Атрибуция — Некоммерческое использование — Без производных произведений») 4.0 Всемирная.
