ГЕНОТИПИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ОВЕЦ БУУБЭЙ И ЗАБАЙКАЛЬСКОЙ ПОРОДЫ ПО ГЕНАМ GDF9, CAST, KRT1.2, KAP1.3 И ИХ СВЯЗЬ С ПРОДУКТИВНОСТЬЮ
Аннотация
Целью исследования является выявление полиморфизма генов GDF9, CAST, KRT1.2, KAP1.3 и изучение их влияния на живую массу и шерстную продуктивность овец забайкальской тонкорунной породы и грубошерстной буубэй. Научная новизна заключается в том, что впервые проведена сравнительная оценка генотипических особенностей овец по SNP-маркерам и их ассоциативным связям с продуктивностью в породах. Объектом исследования были овцы забайкальской тонкорунной (100 голов), грубошерстной буубэй (60 голов). В результате исследований установлено, что по генам GDF9/G1 и CAST породы имеют практически одинаковое соотношение генотипов и аллелей, по генам KRT1.2 и KAP1.3 выявлены значительные различия. Порода буубэй характеризуется более высоким на 17,7 % содержанием генотипа KRT1.2MM и более низкой на 15,7 % частотой генотипа KRT1.2MN, по сравнению с забайкальской тонкорунной породой. Частота генотипов гена KAP1.3 в породе буубэй выявлена в соотношении (26,7:46,6:26,7), в забайкальской (61,6:36,0:3,0). Генное равновесие в стадах не нарушено, (χ2= 0,006 - 0,713). Инбридинг в стадах отсутствует (Fis - 0,0037 до +0,066), PIC находится в пределах 0,192. и 0,203. Коэффициент гомозиготности SH – 17,7 и 9,5 %, Naj -1,32 и 1,27. Установлено, что бараны с генотипом CASTMM имеют более высокую живую массу на 20,2 кг, по сравнению с гетерозиготными животными. У овец породы буубэй с генотипом KRT1.2MM пух был длиннее на 0,58 см, чем у животных с гетерозиготным генотипом KRT1.2MN. В забайкальской породе приоритетных генотипов, связанных с продуктивностью не выявлено. Сложившаяся структура забайкальской породы и буубэй может служить базой для мониторинга генотипической структуры этих пород и в сравнительной оценке с другими породами Сибири. Выявленные ассоциативные связи генетических маркёров с шерстной продуктивностью могут успешно использоваться в качестве дополнительных критериев для отбора овец по селекционным признакам.
Скачивания
Литература
Список литературы
Генетическая структура овец западно-сибирской мясной и кулундинской тонкорунной пород по генам CAST, GDF9 и KRT1.2 / О.Л. Халина, С.Н. Магер, Г.М. Гончаренко, Т.С. Хорошилова, Н.Б. Гришина // Известия Тимирязевской сельскохозяйственной академии. 2022. Вып. 4. С. 103-116. https://doi.org/10.26897/0021-342X-2022-4-103-116
Ежегодник по племенной работе в овцеводстве и козоводстве в хозяйствах Российской Федерации (2022 год) / Г.И. Шичкин, Г.Ф. Сафина, Х.А. Амерханов, В.В. Чернов, Л.Н. Григорян, Г.Н. Хмелевская, С.А. Хататаев, А.В. Равичева, Н.Г. Степанова. Москва: Издательство ФГБНУ ВНИИплем, 2023. 324 с.
Изменчивость микросателлитов в породах овец, разводимых в России / Т.Е. Денискова, М.И. Селионова, Е.А. Гладырь, А.В. Доцев, Г.Т. Бобрышева, О.В. Костюнина, Г. Брэм, Н.А. Зиновьева // Сельскохозяйственная биология. 2016. Т. 51. № 6. С. 801-810. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2016.6.801rus
Колосов Ю.А., Гетманцева Л.В., Широкова Н.В. Полиморфизм гена GDF9 у овец сальской породы // Ветеринарная патология. 2014. № 3-4. С. 78-81.
Лушников В.П., Фетисова Т.О., Стрильчик А.А. Полиморфизм гена CAST у овец татарстанской и эдильбаевской пород // Овцы, козы, шерстяное дело. 2020. № 2. C. 9-11.
Митыпова Е.Н., Цыбикова Р.Н. Совершенствование овец аборигенной бурятской грубошерстной породы в направлении повышения продуктивности // Вестник Алтайского государственного университета. 2017. № 1 (147). С. 104-110.
Погодаев В.А., Кононова Л.В., Адучиев Б.К. Полиморфизм генов кальпастатина и соматотропина у овец калмыцкой курдючной породы и помесей (1/2 калмыцкая курдючная + 1/2 Дорпер) // Вестник Ульяновской государственной сельскохозяйственной академии. 2019. N 3(47). C. 141-145. https://doi.org/10.18286/1816-4501-2019-3-141-145
Полиморфизм гена CAST, особенности жирнокислотного состава липидов крови овец разных генотипов в онтогенезе / Л.Н. Чижова, Е.С. Суржикова, Е.Д. Луцива, Н.И. Ефимова // Вестник Курской государственной сельскохозяйственной академии. 2020. N 6. С. 47-51.
Полиморфизм гена KRT1.2. у отечественных пород овец / Р.Ю. Сенина, Л.А. Калашникова, В.П. Лушников, М.Б. Павлов // Овцы, козы, шерстяное дело. 2018. №3. С. 20-23.
Полиморфизм гена KAP 1.3 у отечественных пород овец разного направления продуктивности / Р.Ю. Сенина, Л.А. Калашникова, В.П. Лушников, К.К. Цой // Овцы, козы, шерстяное дело. 2019. №4. С. 10-12.
Селионова М.И., Евлагина Д.Д., Светличный С.И. Полиморфизм гена GDF9 и его связь с молочной продуктивностью овец породы Лакон // Молекулярно-генетические технологии анализа экспрессии генов продуктивности и устойчивости к заболеваниям животных: Материалы Третьей Международной научно-практической конференции в рамках года науки и технологий Российской Федерации по тематике «Генетика и качество жизни». 2021. C. 396-403.
Сравнительная оценка генофондов пород овец на основании ISSR-анализа / Л.В. Нестерук, Н.Н. Макарова, А.Н. Евсюков, С.Г. Рвищева, Б.Б. Лхасаранов, Ю.А. Столповский // Генетика. 2016. Т. 52. №3. С. 346-356. https://doi.org/10.7868/S0016675816030115
Формирование мясной продуктивности у бычков разных генотипов DGAT1 / Т.А. Седых, Л.А. Калашникова, И.Ю. Долматова, Р.С. Гизатуллин, В.И. Косилов // Siberian Journal of Life Sciences and Agriculture. 2023.Vol. 15, № 3. С. 156-174. https://doi.org/10.12731/2658-6649-2023-15-3-155-174
Чесноков Ю.В., Артемьева А.М. Оценка меры информационного полиморфизма генетического разнообразия // Сельскохозяйственная биология. 2015. Т. 50. № 5. С. 571-578. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2015.5.571rus
Шерстная продуктивность и качество шерсти овец породы Российский мясной меринос от внутри-и межлинейного подбора / Е.Н. Чернобай, А.И. Суров, Н.А. Резун, О.Н. Онищенко, С.А. Олейник // Siberian Journal of Life Sciences and Agriculture. 2023. T. 15. № 1. С. 179-206. https://doi.org/10.12731/2658-6649-2023-15-1-179-207
A 5-Methylcytosine Site of Growth Differentiation Factor 9 (GDF9) Gene Affects Its Tissue-Specific Expression in Sheep / Z. Pan, X Wang., R Di., Q. Liu, W Hu., X. Cao, X Guo, X. He, S. Lv, F.Li, H. Wang, M. Chu // Animals. 2018. Vol. 8(11). https://doi.org/10.3390/ani8110200
Calpastatin (CAST) gene polymorphism in Kajli, Lohi and Thalli sheep breeds / M. Suleman, S.U. Khan, M.N. Riaz NRiaz M. Yousaf, Abdullah. Shah, R. Ishaq, A. Ghafoor // African Journal of Biotechnology. 2012. Vol. 47, № 11. P. 10655-10660. https://doi.org/10.5897/AJB11.2478
Effect of the gene GDF9 on the weight of lambs at birth / L. Getmantseva, N. Bakoev, N. Shirokova, M. Kolosova, S. Bakoev, A Kolosov. A. Usatov, V. Shevtsova, Yu. Kolosov // Bulgarian Journal of Agricultural Science. 2019. Vol. 25(1). P. 153-157. https://www.agrojournal.org/25/01-21.pdf
GDF9 gene polymorphism and its association with litter size in two Russian sheep breeds / I.F. Gorlov, Y.A. Kolosov, N.V. Shirokova Lyubov V. Getmantse, M.I. Slozhenkina, N.I. Mosolova, N.F. Bakoev, M.A. Leonova, A.Yu. Kolosov, E.Yu. Zlobina // Rendiconti Lincei. Scienze Fisiche e Naturali. 2018. Vol. 29. P. 61-66. https://doi.org/10.1007/s12210-017-0659-2
Determination of CAST gene polymorphism in sheep of the Volgograd breed / Yu.A. Kolosov, I.F. Gorlov, A.Yu. Kolosov, N.V. Shirokova, A.Ya. Kulikova, M.A. Kolosova, M.I. Slozhenkina, E.S. Vorontsova, N.N. Kolosova // IV international conference on agribusiness, environmental engineering and biotechnologies Agritech-iv-2020. IOP conference series: earth and environmental science, Krasnoyarsk. 2021. P. 1-7. https://doi.org/10.1088/1755-1315/677/5/052112
Itenge-Mweza T.O. Identification of genetic markers associated with wool quality traits in merino sheep. Ph.D. Thesis, Lincoln University, Christchurch, New Zealand. 2007. 225 p.
Khederzadeh S., Iranmanesh M., Motamedi-Mojdehi R. Genetic diversity of myostatin and calpastatin genes in Zandi sheep // Journal of Livestock Science and Technologies. 2016. Vol. 4(1). P. 45–52. https://en.civilica.com/doc/862246/
KRT 1.2 gene polymorphism & its association with wool traits in Rambouillet sheep / V.P. Singh, RK. Taggar, D. Chakraborty, B.P Singh, P. Khajuria, S. Singh, P. Gupta // The Pharma Innovation Journal. 2022. Vol. 11(6). P. 2619-2621.
Mutations in the genes for oocytederived growth factors GDF9 and BMP15 are associated with both in-creased ovulation rate and sterility in Cambridge and belclare ship (Ovis aries) / J.P. Hanrahan, S.M. Gregan, T.P. Milsan // Biology of Reproduction. 2004. Vol. 70 (4). P. 900-909. https://doi.org/10.1095/biolreprod.103.023093
Nucleotide variation in the ovine KRT3.1 promoter region and its association with variation in wool traits in Merino-cross lambs / W. Chai, H. Zhou, H. Gong, J. Wang, Y. Luo, J. Hickford // The Journal of Agricultural Science. 2019. Vol. 157(2). P. 182-188. https://doi.org/10.1017/S0021859619000406
Polymorphism of genes CAST, GH, GDF9 of sheep of the Dagestan mountain breed / A.A. Ozdermirov, L.N. Chizhova, A. A. Khozhokov, E.S. Surzhikova, G.D. Dogeev, S.Sh. Abdulmagomedov // South of Russia: ecology, development. 2021. Vol. 16. No 2. P. 39-44. https://doi.org/10.18470/1992-1098-2021-2-39-44
Polymorphism of the KAP 1.1, KAP 1.3 and K33 genes in merino sheep / T.O. Itenge-Mweza, R.H.J. Forres, G.W. McKenzie, H. A., Abbot J., O. Amoafo, J.G.H. Hickford // Molecular and Cellular Probes. 2007. Vol. 21. P. 338-342. https://doi.org/10.1007/s12210-017-0659-2
Polymorphism of KRT 1.2 and KAP 1.3 genes in Indian sheep breeds / R. Kumar, A.S. Meena, R. Kumari, B. Jyotsana, L.L.L. Prince, S. Kumar // Indian Journal of Small Ruminants. 2016. Vol. 1(22). P. 28-31. https://doi.org/10.5958/0973-9718.2016.00018.0
Three complete linkage SNPs of gene GDF9 affect the litter size probably mediated by OCT1 in hu sheep / Y. Li, W. Jin, Y. Wang, J. Zhang, C. Meng, H. Wang, Y. Qian, Q. Li, and S. Cao // DNA and Cell Biology. 2020. Vol. 39. № 4. P. 563-571. https://doi.org/10.1089/dna.2019.4984
Shahram N., Goodarzi M. Polymorphism of candidate genes for meat production in Lori sheep // IERI Procedia. 2014. Vol. 8. P. 18-23. https://doi.org/10.1016/j.ieri.2014.09.004
References
Genetic structure of sheep of West Siberian meat and Kulunda thin-cross breeds by genes CAST, GDF9 and KRT1.2 / O.L. Khalina, S.N. Mager, G.M. Goncharenko, T.S. Khoroshilova, N.B. Grishina. Izvestiya Timiryazevskoy sel'skokhozyaystvennoy akademii, 2022, no. 4, pp. 103-116. https://doi.org/10.26897/0021-342X-2022-4-103-116
Yearbook on pedigree work in sheep and goat breeding in farms of the Russian Federation (2022) / G.I. Shichkin, G.F. Safina, H.A. Amerkhanov, V.V. Chernov, L.N. Grigoryan, G.N. Khmelevskaya, S.A. Khatataev, A.V. Ravilov. Chernov, L.N. Grigoryan, G.N. Khmelevskaya, S.A. Khatataev, A.V. Ravicheva, N.G. Stepanova. Moscow, 2023, 324 p.
Variability of microsatellites in sheep breeds bred in Russia / T.E. Deniskova, M.I. Selionova, E.A. Gladyr, A.V. Dotsev, G.T. Bobrysheva, O.V. Kostyunina, G. Bram, N.A. Zinovieva. Agricultural Biology, 2016, vol. 51, no. 6, pp. 801-810. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2016.6.801rus
Kolosov Yu.A., Getmantseva L.V., Shirokova N.V. Polymorphism of the GDF9 gene in sheep of the Salish breed. Veterinary Pathology, 2014, no. 3-4, pp. 78-81.
Lushnikov V.P., Fetisova T.O., Strilchik A.A. Polymorphism of the CAST gene in sheep of Tatarstan and Edilbaev breeds. Sheep, goats, wool business, 2020, no. 2, pp. 9-11.
Mitypova E.N., Tsybikova R.N. Improvement of sheep of aboriginal Buryat rough-wooled breed in the direction of increasing productivity. Bulletin of Altai State University, 2017, no. 1 (147), pp. 104-110.
Pogodaev V.A., Kononova L.V., Aduchiev B.K. Polymorphism of calpastatin and somatotropin genes in sheep of Kalmykian Kurdy breed and ponies (1/2 Kalmykian Kurdy + 1/2 Dorper). Bulletin of the Ulyanovsk State Agricultural Academy, 2019, no. 3(47), pp. 141-145. https://doi.org/10.18286/1816-4501-2019-3-141-145
CAST gene polymorphism, features of fatty acid composition of blood lipids of sheep of different genotypes in ontogenesis / L.N. Chizhova, E.S. Surzhikova, E.D. Lutsiva, N.I. Efimova. Bulletin of Kursk State Agricultural Academy, 2020, no. 6, pp. 47-51.
KRT1.2. gene polymorphism in domestic breeds of sheep / R.Yu. Senina, L.A. Kalashnikova, V.P. Lushnikov, M.B. Pavlov. Sheep, goats, wool business, 2018, no. 3, pp. 20-23.
KAP 1.3 gene polymorphism in domestic breeds of sheep of different productivity direction / R.Yu. Senina, L.A. Kalashnikova, V.P. Lushnikov, K.K. Tsoi. Sheep, goats, wool business, 2019, no. 4, pp. 10-12.
Selionova M.I., Evlagina D.D., Svetlichnyi S.I. Polymorphism of the gene GDF9 and its relationship with milk productivity of sheep breed Lakon. Molecular genetic technologies for analyzing gene expression of productivity and resistance to diseases in animals: Proceedings of the Third International Scientific and Practical Conference in the framework of the Year of Science and Technology of the Russian Federation on “Genetics and quality of life”, 2021, pp. 396-403.
Comparative evaluation of gene pools of sheep breeds based on ISSR-analysis / L.V. Nesteruk, N.N. Makarova, A.N. Evsyukov, S.G. Rvischeva, B.B. Lhasaranov, Yu.A. Stolpovsky. Genetics, 2016, vol. 52, no. 3, pp. 346-356. https://doi.org/10.7868/S0016675816030115
Formation of meat productivity in steers of different DGAT1 genotypes / T.A. Sedykh, L.A. Kalashnikova, I.Yu. Dolmatova, R.S. Gizatullin, V.I. Kosilov. Siberian Journal of Life Sciences and Agriculture, 2023, vol. 15, no. 3, pp. 156-174. https://doi.org/10.12731/2658-6649-2023-15-3-155-174
14.Chesnokov Yu.V., Artemieva A.M. Evaluation of the measure of information polymorphism of genetic diversity. Agricultural Biology, 2015, vol. 50, no. 5, pp. 571-578. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2015.5.571rus
Wool productivity and wool quality of Russian meat merino sheep from intra- and inter-line selection / E.N. Chernobay. Chernobay, A.I. Surov, N.A. Rezun, O.N. Onishchenko, S.A. Oleinik. Siberian Journal of Life Sciences and Agriculture, 2023, vol. 15, no. 1, pp. 179-206. https://doi.org/10.12731/2658-6649-2023-15-1-179-207
A 5-Methylcytosine Site of Growth Differentiation Factor 9 (GDF9) Gene Affects Its Tissue-Specific Expression in Sheep / Z. Pan, X Wang., R Di., Q. Liu, W Hu., X. Cao, X Guo, X. He, S. Lv, F.Li, H. Wang, M. Chu. Animals, 2018, vol. 8(11). https://doi.org/10.3390/ani8110200
Calpastatin (CAST) gene polymorphism in Kajli, Lohi and Thalli sheep breeds / M. Suleman, S.U. Khan, M.N. Riaz NRiaz M. Yousaf, Abdullah. Shah, R. Ishaq, A. Ghafoor. African Journal of Biotechnology, 2012, vol. 47, no. 11, pp. 10655-10660. https://doi.org/10.5897/AJB11.2478
Effect of the gene GDF9 on the weight of lambs at birth / L. Getmantseva, N. Bakoev, N. Shirokova, M. Kolosova, S. Bakoev, A Kolosov. A. Usatov, V. Shevtsova, Yu. Kolosov. Bulgarian Journal of Agricultural Science, 2019, vol. 25(1), pp. 153-157. https://www.agrojournal.org/25/01-21.pdf
GDF9 gene polymorphism and its association with litter size in two Russian sheep breeds / I.F. Gorlov, Y.A. Kolosov, N.V. Shirokova Lyubov V. Getmantse, M.I. Slozhenkina, N.I. Mosolova, N.F. Bakoev, M.A. Leonova, A.Yu. Kolosov, E.Yu. Zlobina. Rendiconti Lincei. Scienze Fisiche e Naturali, 2018, vol. 29, pp. 61-66. https://doi.org/10.1007/s12210-017-0659-2
Determination of CAST gene polymorphism in sheep of the Volgograd breed / Yu.A. Kolosov, I.F. Gorlov, A.Yu. Kolosov, N.V. Shirokova, A.Ya. Kulikova, M.A. Kolosova, M.I. Slozhenkina, E.S. Vorontsova, N.N. Kolosova. IV international conference on agribusiness, environmental engineering and biotechnologies Agritech-iv-2020. IOP conference series: earth and environmental science. Krasnoyarsk, 2021, pp. 1-7. https://doi.org/10.1088/1755-1315/677/5/052112
Itenge-Mweza T.O. Identification of genetic markers associated with wool quality traits in merino sheep. Ph.D. Thesis, Lincoln University, Christchurch, New Zealand, 2007, 225 p.
Khederzadeh S., Iranmanesh M., Motamedi-Mojdehi R. Genetic diversity of myostatin and calpastatin genes in Zandi sheep. Journal of Livestock Science and Technologies, 2016, vol. 4(1), pp. 45–52. https://en.civilica.com/doc/862246/
KRT 1.2 gene polymorphism & its association with wool traits in Rambouillet sheep / V.P. Singh, RK. Taggar, D. Chakraborty, B.P Singh, P. Khajuria, S. Singh, P. Gupta. The Pharma Innovation Journal, 2022, vol. 11(6), pp. 2619-2621.
Mutations in the genes for oocytederived growth factors GDF9 and BMP15 are associated with both in-creased ovulation rate and sterility in Cambridge and belclare ship (Ovis aries) / J.P. Hanrahan, S.M. Gregan, T.P. Milsan. Biology of Reproduction, 2004, vol. 70 (4), pp. 900-909. https://doi.org/10.1095/biolreprod.103.023093
Nucleotide variation in the ovine KRT3.1 promoter region and its association with variation in wool traits in Merino-cross lambs / W. Chai, H. Zhou, H. Gong, J. Wang, Y. Luo, J. Hickford. The Journal of Agricultural Science, 2019, vol. 157(2), pp. 182-188. https://doi.org/10.1017/S0021859619000406
Polymorphism of genes CAST, GH, GDF9 of sheep of the Dagestan mountain breed / A.A. Ozdermirov, L.N. Chizhova, A. A. Khozhokov, E.S. Surzhikova, G.D. Dogeev, S.Sh. Abdulmagomedov. South of Russia: ecology, development, 2021, vol. 16, no. 2, pp. 39-44. https://doi.org/10.18470/1992-1098-2021-2-39-44
Polymorphism of the KAP 1.1, KAP 1.3 and K33 genes in merino sheep / T.O. Itenge-Mweza, R.H.J. Forres, G.W. McKenzie, H. A., Abbot J., O. Amoafo, J.G.H. Hickford. Molecular and Cellular Probes, 2007, vol. 21, pp. 338-342. https://doi.org/10.1007/s12210-017-0659-2
Polymorphism of KRT 1.2 and KAP 1.3 genes in Indian sheep breeds / R. Kumar, A.S. Meena, R. Kumari, B. Jyotsana, L.L.L. Prince, S. Kumar. Indian Journal of Small Ruminants, 2016, vol. 1(22), pp. 28-31. https://doi.org/10.5958/0973-9718.2016.00018.0
Three complete linkage SNPs of gene GDF9 affect the litter size probably mediated by OCT1 in hu sheep / Y. Li, W. Jin, Y. Wang, J. Zhang, C. Meng, H. Wang, Y. Qian, Q. Li, and S. Cao. DNA and Cell Biology, 2020, vol. 39, no. 4, pp. 563-571. https://doi.org/10.1089/dna.2019.4984
Shahram N., Goodarzi M. Polymorphism of candidate genes for meat production in Lori sheep. IERI Procedia, 2014, vol. 8, pp. 18-23. https://doi.org/10.1016/j.ieri.2014.09.004
Copyright (c) 2024 Galina M. Goncharenko, Timur N. Khamiruev, Solbon M. Dashinimaev, Tatyana S. Khoroshilova, Olga L. Khalina, Natalya B. Grishina
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial-NoDerivatives» («Атрибуция — Некоммерческое использование — Без производных произведений») 4.0 Всемирная.
